Правильно: Ложбинка над верхней губой называется губным желобком.
Почему:
- После слова «называется» нужно употреблять слово в творительном падеже (отвечает на вопрос «кем? чем?»).
- Фраза «губной желобок» в именительном падеже становится в творительном «губным желобком».
Пример: «Эта игрушка называется мячом.»
Ещё варианты слов: «губная бороздка» или научное название «филтрум».